Resposta
O próprio Aluno Especial pode realizar a matrícula na disciplina que ele deseja cursar.
Para isso, ele precisa já estar cadastrado no sistema do SIGAA (quem faz isso é a coordenação do curso), e já ter feito a criação do seu usuário de acesso ao sistema SIGAA. 

O PPG também precisa permitir que Alunos Especiais realizem solicitação de matrícula on-line, habilitando essa opção na tela de configuração de parâmetros do programa.

Na tela dos parâmetros do programa, deve ser marcada a opção SIM na pergunta “Permite matrícula on-line de Alunos Especiais”. Além disso, deve ser definida a quantidade de créditos que um Aluno Especial pode cursar. Para mais informações, acesse o manual da funcionalidade através do link:
https://manuaisdesistemas.ufpe.br/index.php/Configurar_Par%C3%A2metros_do_Programa_Stricto
 
Para os casos em que o aluno não consiga criar seu usuário, ou o usuário do aluno não esteja permitindo essa matrícula, ou a matrícula on-line pelo Aluno Especial não tenha sido habilitada pelo PPG, o coordenador pode fazer essa matrícula para ele.

* Para saber como criar seu usuário do SIGAA, acesse o manual abaixo: 
https://manuaisdesistemas.ufpe.br/index.php/Criar_Usu%C3%A1rio_no_SIGAA

* Para saber como realizar a matrícula, acesse o manual abaixo: 
https://manuaisdesistemas.ufpe.br/index.php/Matr%C3%ADcula_pelo_Discente_Regular_ou_Aluno_Especial